Первым в стране был награжден медалью А. А. Бетанкура «За личный вклад в развитие транспортной науки и образования», был удостоен звания почетного железнодорожника России и Польши. М. И. Воронин был инициатором создания двухтомника «История железнодорожного транспорта России», причем являлся не только автором многих глав, но и основным редактором обоих томов. Написал более 120 научных трудов. В сферу его научной деятельности входили вопросы повышения скоростей на октябрьской железной дороге, в частности на Мурманской дороге, существовавшей в 1916–1959 гг., а также проектирование высокоскоростной магистрали Москва—Ленинград (Петербург).