М. И. Богданович — автор ряда капитальных трудов по военной истории России, Германии, Франции, содержащих богатый фактический материал и ставших ценным вкладом в русскую военную литературу. Основным направлением его трудов было добросовестное и всестороннее исследование исторических фактов; меньше внимания он уделял их критической оценке. Он участвовал в редактировании "Военного журнала", был одним из авторов и редакторов 2-го издания "Военно-энциклопедического лексикона" (в 14 томах) и "Исторического очерка деятельности военного управления России за 1855-1880 гг." (в 6 томах). Им была проведена значительная работа по упорядочению Военно-научного архива. Он опубликовал большое число статей в "Русском инвалиде", "Военном сборнике", "Русской старине" и других журналах. За свои труды М. И. Богданович был награжден орденами Российской империи, а некоторые из его сочинений получили академические премии.