Г. Баязитов вступал в полемику с французским ученым Э. Ренаном, который заявлял о несовместимости положений ислама и рационального знания. В работе «Ислам и прогресс» он утверждал о принципиальной сочетаемости исламской религии и прогресса, а в книге «Отношение ислама к науке и к иноверцам» доказывал, что одним из основополагающих принципов веротерпимости ислама является цивилизованное отношение к верующим других религий. Заслуги Г. Баязитова отмечены золотой и серебряной медалями «За усердие», орденами Святого Станислава 3-й степени и Святой Анны 2-й и 3-й степеней, Бухарской золотой звездой и иранским орденом Льва и Солнца.