С момента окончания МГУ по настоящее время работает в Институте прикладной математики им М.В. Келдыша. Когда академик И.М. Гельфанд организовал группу по работе над медицинскими задачами (в начале 70-х годов), Ю.Б. Котов вошел в эту группу и активно в ней работал. Решение задач информационного обеспечения диагностических проблем медицины привело к самостоятельной работе со многими выдающимися врачами и выработке методов анализа структур медицинских суждений, развивающих направление, ранее созданное работами И.М. Гельфанда и его учеников. Результаты решения нескольких конкретных задач диагностики представлены в этой книге. Защитил докторскую диссертацию по математическим методам формализации и анализа информации, используемой врачом при выработке диагноза больному.