Занимал ответственные посты в Гособразовании СССР, ГКВШ, Госкомвузе и в Министерстве общего и профессионального образования РФ. Участвовал в разработке и осуществлении реформы социально-экономического и гуманитарного образования в СССР и Российской Федерации. Был одним из организаторов разработки и внедрения системы многоуровневого образования и образовательных стандартов ГОС ВПО первого поколения. Инициатор создания системы дистанционного образования в России.
В. С. Меськовым получены существенные результаты в области методологии науки и логики научного исследования. В последнее время его научные интересы сосредоточены в области общей методологии. Вместе со своей научной школой он работает над созданием методологического инструментария постнеклассической науки. Ему удалось заложить основы новой трансдисциплинарной философии образования как философии когнитивного субъекта.
В настоящее время В. С. Меськов — заведующий кафедрой философии образования Московского института открытого образования. Член Московской городской организации Союза писателей России.