В своих философских работах П. Д. Юркевич развил своеобразный вариант христианского платонизма. Идея, по его мнению, есть объективно реальная сущность вещи, ее разумная основа, «норма» и «закон» ее существования. Признавая значение опыта и наблюдения, он выдвигал требование находить и толковать идею через явления реальной действительности. В основе антропологии П. Д. Юркевича — библейское учение о роли «сердца» как средоточия всей духовной жизни человека, являющегося, согласно Юркевичу, предпосылкой истинного познания. Темы работ Юркевича во многом определили проблематику последующего развития философского идеализма в России (например, у В. С. Соловьева, П. А. Флоренского, отчасти Г. Г. Шпета и др.). Известность получили и труды П. Д. Юркевича по педагогике, в том числе «Чтения о воспитании» (1865) и «Курс общей педагогики с приложениями» (1869) — одна из лучших книг по педагогике на русском языке того времени.