А. А. Кауфман — автор многих работ по вопросам земплепользования и землевладения в Сибири, аграрным общинам, переселенческим вопросам, статистике. В своих трудах об общине он проводил мысль, что общинно-передельные формы — не продукт какого-либо внешнего воздействия, а результат естественной эволюции, двигателем которой является земельное «утеснение»; община, как организованный союз, не создает этих форм, а сама складывается вместе с ними. В вопросе переселения он сформулировал и развил теорию относительного малоземелья, обусловливаемого кризисом данного строя хозяйства. Известность получили его работы: «Крестьянская община в Сибири» (1897), «Переселение и колонизация» (1905), «Русская община в процессе ее зарождения и роста» (1908), «Формы хозяйства в их историческом развитии» (1910), «Статистика. Ее приемы и ее значение для общественных наук» (1911), «Аграрный вопрос в России» (1918) и другие.