Научное наследие С. М. Широкогорова очень обширно и разносторонне; оно включает работы по теории этноса, шаманизму, физической антропологии народов Сибири и Китая, социальной организации маньчжур, тунгусо-маньчжурской лингвистике и другие исследования. Еще в начале века он высказал ряд глубоких идей об интегральности научного знания о различных народах, о целостности и равновесии культуры общества, о роли наблюдателя в этнологии. В своих работах владивостокского и эмигрантского периодов С. М. Широкогоров предстает как специалист энциклопедического уровня, рассматривающий проблемы антропологии, этнографии, лингвистики, социальной организации, материальной культуры, психологии, традиционных верований и духовной жизни различных тунгусо-маньчжурских народов. Он впервые разработал принципиально новые идеи об этносе, этнологии, шаманизме и др. Его основные труды неоднократно переиздавались в Европе и США; их переводы выходили в Китае и Японии.