Л. О. Чернейко — автор многих научных публикаций, среди которых: «Содержание слова как объект структурной и когнитивной семантики» (2003), «Базовые понятия когнитивной лингвистики в их взаимосвязи» (2005), «Новые объекты и инструменты лингвистики в свете старых понятий» (2007), «Язык исследователя как выражение его мировоззрения» (2008), «Металексемы русского языка: лексикографическая интерпретация и общие принципы семантического анализа» (2008), «Философско-лингвистический аспект изучения моды» (совместно с Д. Башкатовой; 2008), «Метафизика и поэтика в научном идиолекте» (2009), «М. В. Ломоносов и язык науки» (2011), «Полиморфный языковой знак как психолингвистический феномен» (2015), «Философия языка и лингвистики» (2016), «Мифологемы сознания: Вербализация и интерпретация» (2018), «Понятия “проекция” и “проективный смысл” в терминосистеме когнитивной лингвистики» (2018), «Вероятностный мир языковой личности (применительно к анализу художественного текста)» (2020), «Читательское восприятие в науке о литературе: к истории и теории вопроса» (2023). Монографии: «Как рождается смысл: Смысловая структура художественного текста и лингвистические принципы ее моделирования» (2017), «Медиалингвистика в современной научной парадигме» (коллективная монография, 2025).