Крупный ученый, специалист в области генетики и философских проблем биологии, академик АН Украины. Окончил медицинский факультет Московского государственного университета. Стажировался в США у лауреата Нобелевской премии по физиологии и медицине Г. Дж. Мёллера, в Германии у выдающегося биолога и генетика Р. Гольдшмидта. В Москве работал в лаборатории члена-корреспондента АН СССР А. С. Серебровского. Принимал участие в первых опытах по радиационному мутагенезу у дрозофил, проведенных в России, и в обосновании сложности структуры гена. Защищал генетику от идеологических нападок.
В области философии И. И. Агол принадлежал к школе диалектиков. Один из ближайших учеников и последователей академика АН СССР А. М. Деборина. После разгрома деборинской философской школы преследовался как "меньшевиствующий идеалист". В 1936 г. арестован и 8 марта 1937 г. расстрелян.