Е. М. Бабосов — крупный ученый, обогативший философскую и социологическую науку трудами большого научного значения. Он — основатель белорусской социологической школы, пользующейся признанием в странах СНГ и дальнего зарубежья, создатель социологической теории катастроф, разработчик теоретических моделей предупреждения и разрешения социальных кризисов и конфликтов, социально-стратификационных трансформаций и формирования эффективного государства в постсоветском обществе переходного типа. Им разработаны новые концептуальные подходы к использованию взаимосвязи социального и научно-технического прогресса, становления и развития духовного мира человека, формирования личности. Широкую известность получили его работы, исследующие философско-методологические проблемы научного познания, гносеологические механизмы научных революций, особенности взаимодействия научно-технического и социального прогресса, основные особенности и пути развития духовной культуры, главным образом таких ее важнейших компонентов, как наука, образование, нравственность, искусство, религия.
Под руководством Е. М. Бабосова защищено 64 кандидатских и 17 докторских диссертаций по философским и социологическим наукам. Им опубликовано более 820 научных работ, из них 35 монографий и учебников. Лауреат Государственной премии Беларуси, заслуженный деятель науки Республики Беларусь. Работы академика Е. М. Бабосова издавались на английском, французском, итальянском, немецком, испанском, чешском, польском, болгарском языках.