В 1997–2000 гг. работал в федеральных министерствах, ответственных за реализацию региональной политики и развитие федеративных отношений. Имеет квалификационный разряд «Государственный советник Российской Федерации 1 класса».
С 2000 г. — сотрудник Института системного анализа РАН, где в 2003 г. защитил диссертацию на соискание ученой степени доктора экономических наук.
С 2002 г. — директор Института реформирования общественных финансов.
С 2010 г. — заведующий кафедрой Российской академии народного хозяйства и государственной службы при Президенте РФ.
Сайт www.klimanov.ru