Основные труды, в том числе четыре книги, посвящены исследованию истории эволюционной мысли недарвиновской ориентации XX века, а также истории биологии XX века в целом. По мнению научной общественности, монография «Учение о макроэволюции. На путях к новому синтезу» (1991) внесла весомый вклад в эволюционную теорию. Книга широко цитируется и широко используется в педагогической практике высшей школы России и стран ближнего зарубежья. Она включена в список рекомендованной литературы, приводимой в ряде учебников.
Соискатели, поступающие в аспирантуру ИИЕТ, вот уже десятки лет широко пользуются коллективной монографией «История биологии. С начала XX века до наших дней» (1975), материал которой собран и отредактирован автором.
В период с 1970 по 1989 гг. В. И. Назаров был ответственным секретарем серии «Историко-биологические исследования». До 2001 г. в течение 22 лет был бессменным секретарем диссертационного совета К003.11.01. За этот период успешно защитили кандидатские диссертации порядка 45 соискателей и несколько соискателей на степень доктора.
В течение 5 лет (до 2001 г.) руководил проблемной группой социальной истории биологии.