Ю. Д. Дешериев — автор научных трудов по чеченскому, бацбийскому, хиналугскому языкам, пятитомной энциклопедии «Языки народов СССР» (1966–1968). Им подготовлены научные работники и преподаватели по кавказоведению и общему языкознанию для научно-исследовательских институтов и вузов России и других республик бывшего СССР. Он также создал новейшее направление в языкознании — социальную лингвистику, организовал специальное подразделение в структуре Института языкознания — отдел социолингвистики, ставший в настоящее время Центром социально-лингвистических исследований. Автор более 340 фундаментальных научных трудов, в числе которых 10 монографий.