А. И. Пузыревский — автор книг по теории музыки, древнерусскому церковному пению, истории Русского музыкального общества и Петербургской консерватории, а также известных в свое время учебников элементарной теории музыки, инструментовки и других. Одним из ценнейших учебных пособий по элементарной концепции музыки заслуженно считается написанное им сочинение "Музыкальное образование: Основы музыкально-теоретических знаний". Материал этой книги автор изложил в форме, придающей ей характер самоучителя в деле музыкального образования. В число его трудов также вошли: "Методические заметки по преподаванию пения в народных школах", "Изучение аккордов по слуху и голосом", "Пение в семейном воспитании", "Очерк исторического развития церковно-богослужебного пения на западе и на востоке до IX века и в России до половины XIX века", "Учебник элементарной теории музыки в объеме курса консерваторий с приложением вопросов и более важных практических упражнений по всем отделам", "Краткое руководство по инструментовке и сведения о сольных голосах и хоре: Пособие для чтения партитур", "Императорское Русское музыкальное общество в первые 50 лет его деятельности (1859–1909)" и другие.