Г. Аллисон был специальным советником министра обороны при президенте Р. Рейгане и заместителем министра обороны при президенте У. Клинтоне. Единственный, кто был дважды удостоен высшей награды Министерства обороны США для гражданских лиц — медали «За выдающуюся государственную службу». Был членом Совета по оборонной политике при Министерстве обороны на протяжении многих лет, когда это ведомство возглавляли К. Уайнбергер, Ф. Карлуччи, Р. Чейни, Л. Аспин, У. Перри и У. Коэн.
Последняя книга Г. Аллисона Nuclear Terrorism: The Ultimate Preventable Catastrophe — «Ядерный терроризм: Самая страшная, но предотвратимая катастрофа» — вышла в свет в 2004 г. и была включена газетой «Нью-Йорк Таймс» в список ста наиболее значимых книг 2004 года. Книга неоднократно переиздавалась. На русском языке вышла в издательстве URSS в 2007 г.