Российский журналист, издатель, изобретатель, основатель научно-популярного журнала «Наука и жизнь». Родился в селе Кичменгский Городок Вологодской губернии, в семье священника; брат известного богослова Н. Н. Глубоковского. Учился в Вологодской духовной семинарии, в Лазаревском институте восточных языков (Москва). Сочувствовал народникам, за что в 1876 г. был арестован, а в 1878 г. отдан под негласный надзор полиции. В 1885 г. окончил медицинский факультет Московского университета. Работал в газете «Московские ведомости», сотрудничал с рядом других российских газет и журналов («Московский телеграф», «Русское слово», «Новое время», «Русское обозрение» и другие). Исполнял обязанности дежурного врача при Императорских московских театрах. В 1890 г. с целью просвещения и популяризации научных знаний основал журнал «Наука и жизнь»; в 1894 г. — его «практическое» приложение, журнал «Дело». Последний номер «Науки и жизни» под его редакцией вышел в сентябре 1900 г.
Получив разностороннее образование, М. Н. Глубоковский сделал своей основной деятельностью журналистику. Уже к 1882 г. он вел руководящие отделы в «Московских ведомостях», выступал с научными обзорами, писал передовые статьи. Помимо этого, он был широко известен как лингвист, врач и изобретатель: им была разработана теория построения всемирно-научного языка (до появления эсперанто), придумана оригинальная система предсказания погоды, созданы карманный бильярд, высотомер, механическая камнедробилка, аппарат для печатания красками на тканях. В медицинской практике того времени применялись его приспособления и приборы для лечения невралгии, а также прибор «Пневма», помогавший при легочных и горловых болезнях. Известность получил и его труд «Гигиена голоса», опубликованный в 1889 г.