В своих философских сочинениях Г. Е. Струве пытался построить цельную философскую систему идеального реализма, которую он называл «идеально-реальным» миропониманием (или «синтетической философией») и в которой он стремился примирить противоречия между духом и материей, свободой и необходимостью, искусством и наукой, церковью и государством и т. д. По определению Струве, философия изучает общее в частном, а специальные науки, основой которых является математика, — частное в общем; предметом последних служит познание явлений, предметом философии — объяснение явлений. Известность получили его труды: «Отличительные черты философии и их значение в сравнении с другими науками» (1872), «Введение в философию. Разбор основных начал философии вообще» (1890), «Способности и развитие философствующего ума» (1897), «Современная анархия духа и ее философ Фр. Ницше» (1900), «Этическое движение Новейшего времени. Его история и учение» (1901) и другие.