|
Содержание
Из предисловия к первому изданию Из предисловия к третьему изданию Предисловие к четвертому изданию Введение Часть I. Биофизика сложных систем Раздел I. Кинетика биологических процессов ГЛАВА 1. Качественные методы исследования динамических моделей биологических процессов § 1. Общие принципы описания кинетического поведения биологических систем § 2. Качественное исследование простейших моделей биологических процессов § 3. Качественные методы исследования систем дифференциальных уравнений ГЛАВА 2. Типы динамического поведения биологических систем § 1. Биологические триггеры § 2. Колебательные процессы в биологии. Предельные циклы § 3. Иерархия времен в биологических системах § 4. Стохастические модели взаимодействия ГЛАВА 3. Кинетика ферментативных процессов § 1. Простейшие ферментативные реакции § 2. Множественность стационарных состояний в ферментативных системах § 3. Колебания в ферментативных системах § 4. Вероятностное описание переноса электрона в мультиферментном комплексе § 5. Математическое моделирование метаболических путей ГЛАВА 4. Процессы самоорганизации в распределенных биологических системах § 1. Общая характеристика автоволновых процессов § 2. Математические модели самоорганизующихся структур § 3. Хаотические процессы в детерминированных системах Раздел II. Термодинамика биологических процессов ГЛАВА 5. Термодинамика систем вблизи равновесия (линейная термодинамика) § 1. Первый и второй законы термодинамики § 2. Второй закон термодинамики в открытых системах § 3. Соотношение между значениями движущих сил и скоростей процессов § 4. Термодинамические критерии достижения и устойчивости стационарных состояний ГЛАВА 6. Термодинамика систем вдали от равновесия (нелинейная термодинамика) § 1. Общие критерии устойчивости стационарных состояний § 2. Термодинамика нелинейных кинетических систем § 3. Энтропия, информация и биологическая упорядоченность Часть II. Молекулярная биофизика Раздел III. Пространственная организация биополимеров ГЛАВА 7. Пространственные конфигурации полимерных молекул § 1. Статистический характер организации полимеров § 2. Объемные взаимодействия и переходы глобула - клубок в полимерных макромолекулах § 3. Фазовые переходы в белках ГЛАВА 8. Различные типы взаимодействий в макромолекулах § 1. Взаимодействия Ван-дер-Ваальса § 2. Водородная связь. Заряд-дипольные взаимодействия § 3. Внутреннее вращение и поворотная изомерия ГЛАВА 9. Конформационная энергия и пространственная организация биополимеров § 1. Конформационная энергия полипептидной цепи § 2. Численные методы оценки конформационной энергии биополимеров § 3. Предсказания пространственной организации белков § 4. Особенности пространственной организации нуклеиновых кислот § 5. Состояние воды и гидрофобные взаимодействия в биоструктурах § 6. Динамика фазовых переходов в макромолекулах § 7. Сворачиваемость белка Раздел IV. Динамические свойства глобулярных белков ГЛАВА 10. Динамика белков § 1. Структурные изменения белков § 2. Конформационная подвижность белков по данным различных методов ГЛАВА 11. Физические модели динамической подвижности белков § 1. Общая характеристика молекулярной динамики биополимеров § 2. Модель ограниченной диффузии (броуновский осциллятор с сильным затуханием) § 3. Численное моделирование молекулярной динамики белков § 4. Молекулярная динамика белка миоглобина § 5. Динамические модели ДНК § 6. Прямое моделирование взаимодействия белков Рекомендуемая литература Предметный указатель |